最近，西班牙的一个研究小组，首次获得了远古猪的部分基因组序列。从西班牙东北部Montsoriu城堡遗址发现的一只16世纪的猪，所得到的数据表明，这只古老的猪与今天的伊比利亚猪关系密切。研究人员还丢弃了“亚洲猪与现代伊比利亚猪杂交”的假说。
相关研究结果发表在最近的Nature出版集团旗下著名遗传学期刊《Heredity》，进一步阐述了猪物种的进化方面，特别是伊比利亚猪种，其被认为是欧洲地中海原始猪种群的代表。这项研究是由西班牙巴塞罗那自治大学(UAB)和农业基因组学研究中心(CRAG)的Miguel Pérez-Enciso带领。来自进化生物学研究所(CSIC-庞培法布拉大学)和国家基因组分析中心(CNAG)的研究人员，也参与了这项研究。
这一样品的日期大约是从1520年到1550年，在亚洲猪引入欧洲之前，后来亚洲猪与当地的欧洲猪品种(是今天国际猪种的起源种)杂交。样品猪与美国殖民地化的开始属于同一时期。
Miguel Pérez-Enciso称：“虽然这是一个非常分散的样品，但是基因序列提供了非常有趣的信息。首先，我们知道它不是白色猪，因为它缺少一个重复的KIT基因，该基因能使猪显示白色。这与那个时期的大多数绘画作品一致，在这些画面中动物总是被涂成黑色或红色色调。我们也能够确定，它与今天的伊比利亚猪关系非常密切，特别是‘Lampiño del Guadiana’品系。我们可以说，伊比利亚猪与第十六世纪存在的猪非常相似，其基因组没有发生很大的变化。因此，在我们能够区分现代种与远古种之前，还需要更多的研究。”
研究表明，这只猪是一只家猪，因为序列提出了一系列的家猪标记，这些序列在野猪(家猪的前体动物)中很罕见或者不存在;此外，这符合城堡的历史记录，记录清楚地表明，猪的育种是一个重要的城堡活动。然而，偶尔也有野猪和古代猪之间杂交的证据，如在野猪和伊比利亚猪之间发生的杂交。
Miguel Pérez-Enciso指出：“伊比利亚猪、欧洲野猪和古代猪之间的这种密切关系，如同以前的研究所述，亚洲猪和现代伊比利亚猪之间的异种交配并不存在，或者是微不足道的。”
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这项研究还比较了古代猪样品与不同品种现代猪的基因组，包括Creole猪，有研究推测它是西班牙殖民者带到美国的猪的后裔。研究表明，这种假设是不正确的，在今天的Creole猪中，西班牙殖民者带来的那些第一批动物很少有剩余，它们主要与国际猪品种进行杂交。
