为了延长菌种的寿命，避免垫料发生霉变，发酵床猪舍要注重通风。发酵床猪舍通风方法有两种，一种是自然通风，一种是机械通风。
一、发酵床养猪需要通风的原因
发酵床养猪技术是利用微生物的作用，分解猪的粪尿产生大量的热量，同时热量将垫料内的水分蒸发到空气中，通过猪舍的气体交换，完成猪舍内的水汽和热量的移除。
发酵床的发酵是一个耗氧过程，如果猪舍内通风不良，微生物的活动就会受到抑制，分解粪便的能力下降，就会导致发酵床上大量的粪便蓄积，厌氧菌种的活动能力增强，氨气味道加重，猪舍内的二氧化碳的浓度增高等等不利的因素。
携带大量水汽的空气密度小，会不断向猪舍的上方运动，因此，猪舍的排气孔要在猪舍的屋顶。如果猪舍没有排气口，湿热的气体就会在屋顶遇冷凝结成水珠，造成水珠反滴，造成发酵床的水分的二次蒸发，加大了发酵床的工作强度。
气体的交换是一个流动的过程，因此必须要有舍外气体的不断流入猪舍内。在黑龙江，由于年平均气温只有4.5-零下6度，一年中的大多数月份都很冷，猪舍的进气口应该高一些，这样进入猪舍的冷空气可以先与舍内的空气混合后，才到达猪的体表，不会因为冷气直接达到猪的体表而引起猪的疾病。
二、发酵床猪舍通风的方法
猪舍通风换气的方法有两种，一是自然通风，二是机械通风。
1、自然通风的设计
自然通风主要是依赖穿越猪舍的气流，也就是要有风的流动。所以猪舍在设计时要充分考虑利用自然通风。要根据猪场的地理位置和当地的气候特点，因地制宜地设计猪舍的通风系统。
（1）猪舍要建造在开阔的高处，远离任何挡风的障碍物。
（2）猪舍间的距离要较大，这样可以减少不同猪舍间的疾病的传播。
（3）猪舍的长轴要与当地的主风向垂直。
（4）猪舍的跨度不要超过15米。
（5）通风口的设计非常重要。
猪舍跨度屋顶的通气孔屋檐的通气孔10米 0.18米 0.09米 12米 0.20米 0.10米 13米 0.22米 0.11米通风口的尺寸务必合适，必须安装在正确的位置，这样进入的新鲜空气均匀散布，并与舍内的空气充分混合。
2、机械通风
猪舍机械通风多采用负压通风设备，如、湿帘墙+风机，这些都是目前猪场比较流行的通风降温配置。冬季猪舍保温可采用屋顶无动力风机通风换气。
