猪只进入发酵床后就进入一个有益菌占主导的微生态环境。基本饲养管理与传统养猪相同。应注意以下事项：
1) 猪只进发酵床前进行驱虫，保证健康的猪只进入发酵床。
2) 饲料中添加微生物饲料添加剂，既可以促进猪只健康生长，又可以起到补充有益菌，维护发酵床的作用。
3) 控制猪的饲养密度。 一般体重7-30kg的猪， 占地面面积0.4-1.2 ffl2/头；30-100 kg的猪，占地面面积1.2一1.5 11127头；母猪2-3m2 /头。
4) 翻料及疏粪。每日疏粪，每周需翻动垫料1-2次，深约30 cm，特别是猪排粪尿集中的地方需要将猪粪疏散、深翻，将上面的垫料翻入下层。
5) 利用通风或补水，保持发酵床的床面湿度在30%一40%左右。
6) 垫料下降到一定高度后，要补充新的垫料。
7) 猪出栏后，垫料需重新堆积发酵，进行消毒。
8) 为保证猪只的健康和快速生长，饲料中应减少或停止抗生素类药物的添加（有病照常规治疗）。
盛夏炎热季节，最重要的是加强通风。猪只在水泥平台活动休息的时间较多，发酵床自身产热对室温变化影响不大，使用常规的降温措施即可。添加微生物饲料添加剂，可以提高猪只抗热应激的能力。对塑料大棚式的猪圈，要架设遮阳网，降低猪舍内部温度。
