采用发酵床养猪技术的猪群管理要做到如下几点：
1)进猪前彻底消毒。由于发酵垫料内部有大量的益生菌形成生物励屏障，所以垫料表面不用消毒，周围环境的消毒按常规进行。
2)所有猪只在进入发酵床之前，必须进行驱虫，防止将寄生虫带人发酵床，
3)针对性免疫接种。严格执行防疫程序，把好防疫关，做到免疫确实。
4)饲料或饮水中添户添加微生物饲料添加剂，或采用微生物发酵饲料，既可以去除或减少饲料中的抗生素，促进猪只健康生长，又可以起到补充有益菌，维护发酵床的作用。
5)猪群健康监控。对猪群健康状况每天进行查圈评估，当达到具有轻微行症状或严重感染的，或具有典型疾病特征的猪只，及时挑出送至病猪隔离舍进行特殊照顾和治疗，始终保证生产群猪只健康状况良好。
6)控制猪的饲养密度。一般体重7-30kg的猪，0.4一1.2m2/头；30-100媳的猪，1.2-1.5 m2/头；母猪2-3m2／头，特别是炎热的夏天，适当降低饲养密度可以减少猪的热应激。
