运输方式一般有汽运、空运、铁路运输等，常见的为汽车运输。 引种时要有运输经验的专业人员押车。
运输前应准备好《动物运载工具消毒证明》、《出县境动物检疫合格证明》、《五号病非疫区证明》、《种猪免疫卡》、种猪的系谱、发票、对方场的免疫程序、购种合同、饲料配方，个别省市还需要引种方畜牧部门出具的“引种证明”。 运输车辆要有专门的隔栏，防止途中挤压。车底板最好装有苇帘、稻草或麦麸皮，防止肢蹄损伤。
最好用专门运输车辆，防止车辆带病传染种猪，在装猪前12小时用消毒液对车辆及用具进行两次以上彻底消毒。车辆应配备手电、水桶等备用物品。
装猪前最好注射一支长效抗生素(如长效土霉素)，应激敏感种猪可注射镇静剂(如盐酸氯丙嗪)。
长途运输每个隔栏的猪不宜过多，以每头猪都能躺卧为准，但也不宜太少。一则运输成本增加;二则太松反而易损伤种猪。装猪时大小猪分栏装，有爬跨行为的公猪最好使用单栏。
长途运输应尽量走高速公路，避免堵车、急刹车、急转弯，如中途发现异常，随时停车检查，驱使猪只站立，观察有无受压种猪。
装猪时应轻哄慢赶，防止损伤肢蹄。夏季应在早晚凉爽时进行，如气温太高可边装边用水浇淋猪体和车厢。夏季注意通风、防拥挤、防暑、防雨淋和太阳直射;冬季注意保暖防风，但在侧面或后面留有通风处，篷布要有透气性。 装猪完成后要尽快起程，防止停留时间过长，猪只打斗引起损伤。
